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综合新表位预测软件

项目描述

neoepiscope 是用于从 DNA 测序 (DNA-seq) 数据中预测新表位的软件。大多数新表位预测软件将注意力限制在最多一个体细胞突变产生的新表位上,通常只是一个 SNV,neoepiscope 使用 HapCUT2 的组装单倍型输出(Edge 等,2017)来枚举由多个体细胞突变产生的新表位。neoepiscope 还考虑了来自 indel 的移码,并允许使用种系变体对参考转录组进行个性化设置。

项目详情


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源分布

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