一种传染病建模工具。
项目描述
一种比以往更快地创建和测试分区流行病学模型的工具,用于传染病的数学建模。来自https://github.com/henrifroese/infectious_disease_modelling的想法。
DOI 信息
在您的研究中使用 Epispot 的 DOI!:fireworks:
引用:
q9i 和 QLabs。(2021 年 4 月 2 日)。epispot/epispot:(版本 2.1.0)。泽诺多。http://doi.org/10.5281/zenodo.4624423
当前构建状态
| 工作流程 | 地位 |
|---|---|
build.yml |
|
coverage.yml |
|
python-publish.yml |
|
codeql-analysis.yml |
安装
Epispot 可以通过 pip 或 Anaconda 安装。如果使用 pip,请安装:
pip install epispot
对于 Anaconda,通过 conda-forge 安装为:
conda config --add channels conda-forge
conda install -c conda-forge epispot
作为速记,使用import epispot as epi.
您还可以epispot-nightly从 pip 安装软件包:
pip install epispot-nightly
您可以像导入它一样导入它import epispot as epi。两个包不能同时使用。
入门
tests/tutorials从(参见GitHub 存储库)中的教程开始。接下来,查看https://epispot.github.io/epispot上的文档。您可能还会发现查看tests/examples文件夹中的示例很有帮助。
发行说明
有关更多信息,请参阅GitHub 存储库。
特征
-
基于 SIR 的模型
- 易受影响的
- 已感染
- 恢复
- 裸露
- 死的
- 批判的
- 住院
-
自定义的隔间模型
Model使用类创建自定义模型
-
绘图功能
- 绘制
.csv文件中的真实数据 - 以交互方式绘制模型预测
- 比较不同的模型预测
- 绘制
关于文档的说明
可以从函数、类和文件文档字符串轻松访问文档。Docstrings 提供了关于某个函数的附加文档。它们可以通过内置的 Pythonhelp()命令访问。这些字符串以 Github 风格的降价格式进行格式化。此外,所有文件都有一个“结构”标签。
学分
Epispot 包由以下贡献者支持:
- 软件与开发主管:@quantum9innovation
- 代码维护负责人:@Quantalabs
项目详情
下载文件
下载适用于您平台的文件。如果您不确定要选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。