生物序列分析工具
项目描述
魔典
grimoire 包包含用于生物序列分析的库和脚本。
免责声明
当前的开发人员非常不稳定,还没有准备好供公众消费。
设计注意事项
该代码的设计考虑了以下分析:
- 使用隐马尔可夫模型和变体进行基因结构预测
- 基因组注释质量控制
- 序列中的结构-功能关系(例如 IME)
程式
程序名称以经典角色扮演游戏“巫术:疯狂霸王的试验场”中的法术名称为主题。
| 姓名 | 意义 | 功能 |
|---|---|---|
| 小牛 | X 射线 | 基因组注释记者 |
| 坎迪 | 定位 | 基因组注释查看器 |
| 哈曼 | 改变 | 基因组切片机 |
| 米尔瓦 | 光 | 嗯建造者 |
| 杜马皮克 | 明晰 | 嗯,摄影师 |
| 卤菜 | 火 | 基本的hmm解码器 |
| 马哈利托 | 大火 | 2-pass基因解码器 |
| 莫利斯 | 恐惧 | 注释比较器(简单) |
| 莫格夫 | 铁 | 序列发生器 |
| 马莫利斯 | 很大的恐惧 | (计划的复杂注释比较器) |
| 马哈曼 | 改变 | (计划中的多基因组切片机) |
| 恶意 | 同意 | (计划中的基因组提升器) |
| 拉哈利托 | 火炬 | (计划中的全基因组解码器) |
| 倾斜等待 | 爆炸 | (计划中的多基因组解码器) |
| 日尔万 | 打消 | (计划的配置文件/对齐解码器) |
| 拉图比奇 | 确认 | (计划的区域标识符) |
贡献者
- 伊恩·科尔夫 (iankorf)
- 汉娜莱曼 (hslyman)
- 亚历克斯·克莱默 (aklreaxmer)
- 刘启嘉 (joyliu-q)
- 余杰克(Angraygs)
致谢
感谢 MO Trebor 和 EW Werdna 的启发。
项目详情
下载文件
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源分布
grimoire-0.0.2.tar.gz
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内置分布
grimoire-0.0.2-py3-none-any.whl
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