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生物序列分析工具

项目描述

魔典

grimoire 包包含用于生物序列分析的库和脚本。

免责声明

当前的开发人员非常不稳定,还没有准备好供公众消费。

设计注意事项

该代码的设计考虑了以下分析:

  • 使用隐马尔可夫模型和变体进行基因结构预测
  • 基因组注释质量控制
  • 序列中的结构-功能关系(例如 IME)

程式

程序名称以经典角色扮演游戏“巫术:疯狂霸王的试验场”中的法术名称为主题。

姓名 意义 功能
小牛 X 射线 基因组注释记者
坎迪 定位 基因组注释查看器
哈曼 改变 基因组切片机
米尔瓦 嗯建造者
杜马皮克 明晰 嗯,摄影师
卤菜 基本的hmm解码器
马哈利托 大火 2-pass基因解码器
莫利斯 恐惧 注释比较器(简单)
莫格夫 序列发生器
马莫利斯 很大的恐惧 (计划的复杂注释比较器)
马哈曼 改变 (计划中的多基因组切片机)
恶意 同意 (计划中的基因组提升器)
拉哈利托 火炬 (计划中的全基因组解码器)
倾斜等待 爆炸 (计划中的多基因组解码器)
日尔万 打消 (计划的配置文件/对齐解码器)
拉图比奇 确认 (计划的区域标识符)

贡献者

  • 伊恩·科尔夫 (iankorf)
  • 汉娜莱曼 (hslyman)
  • 亚历克斯·克莱默 (aklreaxmer)
  • 刘启嘉 (joyliu-q)
  • 余杰克(Angraygs)

致谢

感谢 MO Trebor 和 EW Werdna 的启发。

项目详情


下载文件

下载适用于您平台的文件。如果您不确定要选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。

源分布

grimoire-0.0.2.tar.gz (1.2 MB 查看哈希

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内置分布

grimoire-0.0.2-py3-none-any.whl (28.6 kB 查看哈希)

已上传 py3